L'ONG internationale catholique Service jésuite des réfugiés fut fondée en 1980, à Rome, par Pedro Arrupe, alors supérieur général des jésuites. C'est en 2001, avec l'arrivée d'un nombre croissant de réfugiés en Belgique, que la branche belge bilingue de JRS-International, le Service jésuite des réfugiés Belgique, vit le jour, à la demande des supérieurs des provinces jésuites flamandes et de Belgique-sud de l'époque. Le bureau de l'organisation, établi à Bruxelles, comptait à l'origine trois membres, dont deux jésuites. Par ailleurs, JRS-Belgium dispose d'un réseau de bénévoles, dont plusieurs sont des jésuites, à Bruges, Anvers, Louvain et Liège.

Il fut clair dès le départ que les activités de JRS-Belgium se concentreraient principalement sur les centres fermés pour étrangers en Belgique. En effet, suivant en cela l'esprit de JRS-International, la branche belge se mit en quête des zones oubliées qui connaissent les besoins les plus flagrants. Les centres fermés, qui sont un bon exemple de telles zones, ont toujours constitué une priorité pour JRS-Belgium. Le soutien des mineurs non accompagnés, la défense des intérêts des réfugiés, la sensibilisation de l'opinion et la coopération avec d'autres ONG sont autant d'autres éléments figurant depuis lors au centre de notre programme.

Aujourd'hui, l'équipe se compose de trois collaborateurs et d'un réseau de bénévoles dont l'action se focalise toujours essentiellement sur les centres fermés. La collaboration entre laïcs et religieux au sein de l'organisation permet à celle-ci de répondre aux besoins des réfugiés dans différents domaines.

Le 4 décembre 2007, le JRS-Belgium est devenu une a.s.b.l. Vous pouvez lire les statuts dans le Moniteur Belge.